Useimmille meditaatio on turvallinen harjoitus. Sen aikana voi kuitenkin joskus herätä epämiellyttäviä tunteita, muistoja tai ajatuksia. Tällaiset kokemukset ovat yleensä tilapäisiä eivätkä aiheuta huolta.
Harvinaisissa tapauksissa vaikeudet voivat kuitenkin voimistua tai kestää pidempään. Tutkimuksessa on kuvattu muun muassa voimakasta ahdistusta tai paniikkia, uniongelmia, kuormittavia muistoja, poikkeuksellisen voimakkaita kehon tuntemuksia sekä havaintojen tai minuuden kokemuksen muutoksia.1
Tärkeä varoitusmerkki ei välttämättä ole se, että meditaatiossa tapahtuu kerran jotain epämiellyttävää, vaan kokemuksen voimakkuus ja jatkuvuus. Jos vaikeudet jatkuvat meditaation ulkopuolella, voimistuvat tai vaikuttavat uneesi, arkeesi, työhösi tai ihmissuhteisiisi, meditaatio kannattaa toistaiseksi keskeyttää — tai ainakin vähentää tasolle, joka tuntuu jälleen sopivalta — ja hakea tukea.
Ammatillinen psykologinen tai lääketieteellinen tuki on suositeltavaa erityisesti voimakkaan ahdistuksen, jatkuvan alakuloisuuden, toistuvien paniikkireaktioiden tai pysyvän itsestä tai ympäristöstä irrallaan olemisen tunteen yhteydessä.
Nykyään on myös tutkimusta ja erikoistunutta tukea, jotka käsittelevät nimenomaan meditaatioon liittyviä vaikeita kokemuksia. Brownin yliopiston Clinical and Affective Neuroscience Laboratory tutkii tällaisia kokemuksia tieteellisesti. Cheetah House tarjoaa tietoa ja tukea erityisesti ihmisille, joilla on ollut meditaation kautta kuormittavia tai epätavallisia kokemuksia. Saksankielisissä maissa Institute for Frontier Areas of Psychology and Mental Health (IGPP) tarjoaa neuvontaa hengellisissä ja meditaation aiheuttamissa kriiseissä.
Meditaation tarkoitus ei ole todistaa, kuinka paljon pystyt kestämään. Tilanteesta riippuen harjoituksen muuttaminen, toisen tekniikan valitseminen, tauon pitäminen tai kokonaan lopettaminen voi olla yhtä järkevää kuin jatkaminen.